{"id":324,"date":"2023-03-09T22:47:12","date_gmt":"2023-03-09T21:47:12","guid":{"rendered":"http:\/\/176.180.167.43:8000\/portfolio\/?post_type=portfolio&#038;p=324"},"modified":"2023-03-18T11:14:38","modified_gmt":"2023-03-18T10:14:38","slug":"prediction-de-sensibilisation-cutanee-modele-qspr","status":"publish","type":"portfolio","link":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/?portfolio=prediction-de-sensibilisation-cutanee-modele-qspr","title":{"rendered":"Pr\u00e9diction de Sensibilisation cutan\u00e9e (QSPR model)"},"content":{"rendered":"<p>Il s&rsquo;agit d&rsquo;un projet effectuer lors de mon stage au Laboratoire de Ch\u00e9moinformatique \u00e0 l&rsquo;Universit\u00e9 de Strasbourg.<\/p>\n<p>Abstract :<\/p>\n<p>La sensibilisation cutan\u00e9e qui conduit \u00e0 la sensibilisation cutan\u00e9e est un probl\u00e8me sanitaire et environnemental majeur. C&rsquo;est l\u2019une des manifestations les plus courantes de l&rsquo;immunotoxicit\u00e9 humaine. De nombreux produits chimiques sont impliqu\u00e9s dans la sensibilisation cutan\u00e9e et la dermatite allergique. Il existe de nombreux tests pour pr\u00e9dire la sensibilisation cutan\u00e9e, par exemple, le DPRA est un test in chemico qui permet de pr\u00e9dire la sensibilisation cutan\u00e9e. C&rsquo;est une bonne alternative des\u00a0tests humains et animaux concernant les r\u00e9glementations \u00e9thiques et politiques, de plus c&rsquo;est moins cher que ceux en essais in vitro et in vivo. Pour am\u00e9liorer la pr\u00e9diction de la sensibilisation cutan\u00e9e, des m\u00e9thodes in silico ont \u00e9galement \u00e9t\u00e9 d\u00e9velopp\u00e9es. Par exemple, l&rsquo;application PredSkin permet aux utilisateurs de pr\u00e9dire la sensibilisation aux produits chimiques simplement en donnant la 2D de la mol\u00e9cule structure. Tropsha et son \u00e9quipe[1] ont r\u00e9cemment construit des mod\u00e8les QSPR pour pr\u00e9dire la sensibilisation cutan\u00e9e en utilisant plusieurs ensembles de donn\u00e9es. Leurs mod\u00e8les \u00e9taient bas\u00e9s sur ECFP-4 comme les empreintes digitales et la m\u00e9thode SVM, nous avons donc essay\u00e9 de reproduire un de leurs r\u00e9sultats (un mod\u00e8le pr\u00e9dictif du label DPRA). Nos r\u00e9sultats reproduits \u00e9taient assez similaires aux r\u00e9sultats de Tropsha (BA = 0,81 au lieu de 0,86). Ensuite, nous avons essay\u00e9 de construire notre mod\u00e8le QSPR, qui \u00e9tait bas\u00e9 sur Descripteurs ISIDA d\u00e9velopp\u00e9s par le Laboratoire de Ch\u00e9moinformatique de Strasbourg. Actuellement, notre BA (0,77) est un peu inf\u00e9rieur \u00e0 celui de Tropsha (0,86) mais nous avons plus de mol\u00e9cules dans le domaine d&rsquo;applicabilit\u00e9 (AD), ce qui rend notre mod\u00e8le admissible.<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/176.180.167.43:8000\/portfolio\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/QSPR-Presentation.pptx\">QSPR Presentation Skin sensitization<\/a><\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/176.180.167.43:8000\/portfolio\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/Report-YEGHYAN-Erik.pdf\">Report QSPR Model Skin <\/a><\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/176.180.167.43:8000\/portfolio\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/Report-YEGHYAN-Erik.pdf\">Sensitization<\/a> <a href=\"http:\/\/176.180.167.43:8000\/portfolio\/wp-content\/uploads\/2023\/03\/Poster.pdf\">Poster<\/a><\/p>\n","protected":false},"featured_media":0,"menu_order":0,"template":"","portfolio-category":[9],"portfolio-tag":[],"class_list":["post-324","portfolio","type-portfolio","status-publish","hentry","portfolio-category-chemoinformatique","entry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/portfolio\/324","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/portfolio"}],"about":[{"href":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/portfolio"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=324"}],"wp:term":[{"taxonomy":"portfolio-category","embeddable":true,"href":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fportfolio-category&post=324"},{"taxonomy":"portfolio-tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/portfolio.wakalas.xyz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fportfolio-tag&post=324"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}